新闻
Arrayjet飞行喷墨式生物芯片点样技术用于生产世界最高通量的

Arrayjet Advance生产服务为客户提高芯片产量的同时减少样品消耗
 

 
Ultra Marathon II 在美国巴尔的摩安装后,客户对仪器非常满意。


Ultra Marathon II 加上Jetmax 环境控制系统,实现在极低的温度下进行点样。
 
案例

CDI实验室是一家美国蛋白质组学公司,之前采用低通量接触式的针式点样平台。他们经历了频繁的生产延误,产量降低,批间差异大,样品损失等问题。他们缺少生产高通量、高质量的蛋白芯片的技术平台。随着需求的不断增加,CDI面临有效商业化他们的产品,降低不断上升的设备维修费用的压力。

 
Arrayjet Adance 芯片点样服务

Arrayjet的 Adance 芯片点样服务起始于2011年,非常有效的支持了CDI公司的项目。这种直接面向客户的芯片服务,客户可以直接得到Arrayjet 总部75年的全面的生物芯片经验的支持,来实现他们的蛋白芯片的技术优化,转让和商业化。

 
实验优化

人类蛋白库中的一部分人类蛋白通过Arrayjet公司的Ultra MarathonII飞行喷墨式生物芯片点样平台点到环氧硅烷(图2)和硝酸纤维素膜上,整个点样环境通过Jetmax环境控制系统控制在4°C。通过测试各种点样体积来优化最后的每个点的样品体积。14个微矩阵重复中,样品点圆形形态合格率大于99%。采用该微矩阵获得预期的表达图谱。


图2: 在环氧硅烷芯片上进行试验优化
 
批量点样
更多来自CDI人类蛋白库的蛋白样品被点到200张环氧硅烷和硝酸纤维素玻片上,来进一步分析点样的重复性点样形态(图3)。Arrayjet 的Jetguard 确保在长时间点样过程中最少的样品蒸发。

图3:从人类蛋白库中纯化的一个小组的蛋白样品被点到200块相同的Grace Bio-lab PATH 硝酸纤维素膜上。
 
高密度点样

通过功能学蛋白实验确认,我们成功的进行从针点到Arrayje飞行喷墨式点样的方法学转移。我们进一步评估了Ultra Marathon II飞行喷墨式点样平台进行高密度点样的能力。CDI 人类蛋白库的样品进行一个高密度的六边形矩阵喷点,来评估在不同点样基质上,芯片内和芯片间点样的重复性,以及背景信号。结果显示,芯片具有出非常好的矩阵,没有点的重叠。

 
全人类蛋白组芯片制备
超过19000个GST融合蛋白从CDI 人类蛋白质库中纯化出来,并被重复的喷点到500张芯片上,每个点200pl 的样品 (图4)。实验成功的标准如下:
•>97%的样品需要被点到芯片上
•圆形点数量>90%
•芯片内和芯片间的CV<20%
•具有阳性和正确的功能实验结果

图4: CDI 完整的人类蛋白库样本被喷点到Grace Bio-Labs PATH® 蛋白芯片玻片上。
 
结论

通过方法学的成功转移,CDI 公司目前能生产全球最大的人类蛋白组芯片,一个批次能生产100张3.1 版本的HuProt 芯片。采购Ultra Marathon II飞行喷墨式点样平台让CDI能够制备蛋白组芯片和其他客户定制的芯片。通过这些芯片,客户能使用最小量的临床样品进行上万种蛋白的分子相互作用检测。Arrayjet Advance芯片服务和非接触压电式点样技术显著的提高大规模、高质量的蛋白芯片生产效率。环境控制单元不仅仅保证了完美的样品点形态和矩阵,同时保护了蛋白的天然构象,最终证保实验结果的一致性。

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“CDI 采购Ultra Marathon II 飞行喷墨式点样平台用于研发和生产HuProt 蛋白芯片和杂交瘤细胞筛选项目的特定芯片。CDI正在计划在不远的将来,采用该新技术平台制备单克隆抗体芯片和膜蛋白芯片。 我们选择Arrayjet 是因为我们需要实现通量5倍的提升,而且最好是一台仪器来实现这个目标。Arrayjet的高科技,精确和用户友好的设计是一个明显的优势。 另一个Arrayjet 公司结构的优势在于,他还通过Arrayjet Advance 提供内部芯片服务。我们可以通过数个月,多个项目的测试,来再次加深我们对该平台的信任, 这个平台可以在多个方面提升我们目前运营。” 
Dr. Ignacio Pino, CEO, CDI Laboratories“
 
Arrayjet 的Jetspyder 样品进样装置有效的减少了蛋白样品间任何的交叉污染,我们的蛋白芯片的质量有了显著的提高。此前,我们一个批次仅仅能生产150片质量合格的芯片,这个通量不能满足规模生产和目前以及未来增长的需求。Arrayjet的技术平台能够快速高效的制备1000张芯片的特点对我们有很大的吸引力。”
Dr. Heng Zhu, Professor, Johns Hopkins School of Medicine

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